人或狗DNA与猪DNA的共同点，首先在于它们遵循相同的遗传物质基本规律：都由核苷酸组成，都使用A、T、C、G四种碱基，并通过碱基排列储存遗传信息。不过，共同的结构不等于序列完全相同。比较时要先看研究目标：关注人的遗传特征，选人类样本；研究犬类特征，选狗；考察家畜性状或猪的生物学问题，则选猪。
共同点：分子规则相通，序列各有差别
- 基本结构一致：人、狗和猪的核DNA都以双链形式存在，碱基互补配对，遗传信息由碱基序列承载。DNA复制时，互补配对规律帮助细胞复制遗传信息。
- 基因承担相似任务：三者的基因都参与蛋白质或功能性RNA的生成，影响细胞生长、代谢、发育等过程。许多维持细胞基本运作的基因在不同哺乳动物中可以找到对应关系。
- 基因组不只有编码区：除了编码蛋白质的序列，三者的DNA还包含调控基因表达的区域以及其他非编码序列。调控区域的差异也可能影响基因何时、何处、以何种程度发挥作用。
- 核DNA与线粒体DNA并存：三者的细胞核中有核DNA，线粒体中也有线粒体DNA。两类DNA所处位置、遗传方式和研究用途不同，不能混为同一种样本信息。
这些共同点说明，人、狗、猪之间可以开展遗传学比较；真正决定结论的，仍是具体序列、基因位置、调控方式和研究对象。只凭“同属哺乳动物”不能推断某一段DNA完全相同，也不能把一个物种的检测结果直接套用于另一个物种。
关键差异：染色体数目、序列和性状背景不同
| 比较维度 | 人类DNA | 狗DNA | 猪DNA |
|---|---|---|---|
| 体细胞染色体数 | 46条，23对 | 78条，39对 | 38条，19对 |
| 遗传序列 | 对应人的遗传背景 | 对应犬类遗传背景 | 对应猪的遗传背景 |
| 个体差异来源 | 家系、群体及个体变异 | 品种、家系及个体变异 | 品种、家系及个体变异 |
| 适合回答的问题 | 人的遗传特征与相关研究 | 犬的遗传特点与品种研究 | 猪的遗传特点与家畜性状研究 |
染色体数目是容易辨认的差异，但不是判断亲缘或功能的唯一标准。三者都具有成对染色体，也都存在个体间的遗传变异；同一物种内的不同个体，某些DNA位置也可能不一样。若要比较共同基因，应选择彼此对应的同源区域，而不是把不同物种的整套基因组当作长度相同、位置一一对应的文本直接比较。
按研究目的选择：人的问题选人，犬类问题选狗，猪的性状选猪
研究人类遗传特征：选择人类DNA。人的样本和研究问题相对应，适合讨论人的遗传变异、家系关系或基因功能。狗或猪的DNA即使含有相似基因，也不能代替人类样本回答个体层面的问题。
研究犬类遗传与品种差异：选择狗DNA。犬类不同品种之间存在各自的遗传背景；要分析犬的性状，应把样本、参照序列和结论都限定在犬类范围内。人类DNA只能用于跨物种的基因对应比较，不能用来代表狗的遗传信息。
研究猪的遗传性状：选择猪DNA。涉及猪的生长、繁殖或品种相关研究时，猪本身的基因组更直接。人和狗的对应基因可用于提出比较问题，但无法替代猪样本验证猪的遗传差异。
比较物种间的共同基因：人、狗、猪都可纳入，但应对照同源基因或同一功能区域，并说明比较的是哪一段序列、哪个物种及何种变异。这个选择适合讨论进化关系或基因功能保守性，不适合把“存在共同基因”扩大成“整个DNA相同”。
结论：看共同结构可以并列比较，做具体判断要匹配物种
人或狗DNA与猪DNA共享DNA的基本组成、遗传编码规则及许多细胞功能相关基因；它们在染色体数目、具体序列、调控区域和物种性状上各有差别。若问题指向人的特征，选人类DNA；指向犬类，选狗DNA；指向猪的遗传性状，选猪DNA。只有研究跨物种共同点时，才把三者放在同一比较框架中，并以对应基因或区域为单位得出结论。