小樱和鸣人最后没有在一起。《火影忍者》的故事写到结局时，鸣人与日向雏田结婚，小樱则与宇智波佐助走到一起。两人曾是第七班的同伴，鸣人年少时也喜欢过小樱，但这份好感没有发展成恋爱关系；他们最终成为彼此信赖、共同成长的伙伴。
第七班相遇：喜欢与羁绊并不是一回事
故事初期，鸣人、小樱和佐助组成第七班，在旗木卡卡西的带领下执行任务。小樱当时一心喜欢佐助，对鸣人的热烈追求常常感到不耐烦；鸣人则把小樱看作自己喜欢的女孩，也把佐助当成重要的竞争对手。三个人的关系因此显得别扭，却随着并肩作战逐渐加深。
鸣人对小樱的喜欢是真实存在的，不过早期的心动夹杂着少年气的较劲和渴望被认可。随着经历增加，他开始理解小樱真正珍视的人是谁，也逐渐把注意力放在守护同伴、兑现承诺和追回佐助上。小樱对鸣人的态度也从嫌弃与依赖，转变为尊重、关心和并肩作战的信任。
佐助离开后，两人共同背负的承诺
佐助离开木叶后，小樱请求鸣人把佐助带回来。鸣人答应了她，这个承诺成为他坚持寻找佐助的重要原因之一，但并非唯一原因。对鸣人而言，佐助也是挚友和竞争伙伴；即使佐助一次次拒绝回头，他仍然不愿轻易放弃这段羁绊。
到了五影会谈前后，小樱为了让鸣人不再被追回佐助的承诺束缚，曾当面表示自己喜欢鸣人。那段话并不是两人正式确立恋情的告白。鸣人看出她真正放不下的仍是佐助，也不愿接受一个违背她内心的说法。他继续寻找佐助，是出于自己的选择和对朋友的坚持，而不是因为小樱答应与他交往。
并肩作战之后：从少年心动走向成熟的伙伴关系
第四次忍界大战中，小樱和鸣人都成长为能够独当一面的忍者。小樱凭借医疗忍术和怪力支援战场，也参与对抗强敌；鸣人则在九尾力量与众人协助下承担起关键责任。两人在战斗中互相支援，不再是单方面追逐与被追逐的关系，而是可以托付后背的队友。
小樱会担心鸣人的安危，也会在他失去力量或陷入险境时出手相助；鸣人同样尊重小樱的判断，相信她能与自己共同面对危机。这些情感展现的是深厚的友情与第七班的羁绊，并没有改变两人各自的恋爱归宿。故事的重点也不是让鸣人和小樱配对，而是让他们学会理解彼此，并以自己的方式守护同伴。
原作结局：鸣人和小樱各自走向谁
结局中，鸣人最终与日向雏田组成家庭。雏田长期默默支持鸣人，鸣人也逐渐回应她的感情；两人后来有了儿子博人和女儿向日葵。小樱与佐助则在经历分别、冲突与重逢后走到一起，并育有女儿佐良娜。佐助仍经常在外执行任务，但小樱和女儿一直是他重要的家人。
因此，回答“小樱和鸣人最后在一起了吗”，答案很明确：没有。鸣人曾喜欢小樱，却没有与她结婚；小樱也没有接受鸣人的追求，最终选择佐助。两人的关系从第七班的同伴、少年时期的暗恋与误解，发展为相互信任的战友和朋友。鸣人和雏田、小樱和佐助，则分别组成了自己的家庭。
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